Кафедра фармакологии и традиционной медицины была организована в 1999 году. Ее первым руководителем был декан – организатор медицинского факультета д.м.н., проф. Николаев Сергей Матвеевич. В состав кафедры входили к.м.н. Чукаев Сергей Александрович, Бальхаев Илларион Митрофанович, Базаров Цыремпил Нимаевич. На кафедре велись дисциплины, соответствующие государственному стандарту, такие как фармакология, клиническая фармакология, а так же преподавались предметы традиционной медицины, как фитотерапия, основы лекарствоведения, рефлексотерапия и мануальная терапия.
В период 2002 – 2019 гг. заведующим кафедрой являлся к.м.н., доцент Чукаев Сергей Александрович.
С 2019 г. была переименована в кафедру фармакологии, клинической фармакологии с курсом биохимии, и.о. заведующей стала доцент, к.м.н. Тыхеева Наталья Алексеевна.